深圳EDI許可證（即在線數據處理與交易處理業務經營許可證）的辦理流程主要包括以下幾個步驟：

1. 系統評測
網絡安全評測：企業需對網站進行網絡安全評測，確保網站的安全性和穩定性。
信息安全評測：評測網站的信息安全措施，確保用戶數據的安全。
2. 材料準備
公司營業執照副本掃描件：提供公司最新的營業執照副本。
法人及股東身份證：提交法人和所有股東的身份證掃描件。
公司章程：提供最新的公司章程，需在工商局加蓋檔案查詢章。
社保證明材料：提供至少3名員工近3個月的社保證明。
托管協議及IDC/ISP資質證書：提供服務器托管協議彩色掃描件和托管商的IDC（互聯網數據中心）或ISP（互聯網服務提供商）資質證書復印件。
其他材料：包括互聯網域名注冊證書、股東的相關證件、公司股權結構圖、租賃協議或房產證明、企業商標證書等。
3. 網上審核
提交申請：將準備好的材料通過深圳市通信管理局或其授權機構的官方網站提交。
材料審查：相關部門對提交的材料進行審查，確保材料的完整性和準確性。
4. 制證和領取證書
制證：審核通過后，相關部門將制作EDI許可證。
領取證書：企業需按照指定方式領取EDI許可證，可能需要預約并攜帶相關證件到指定地點領取。
5. 年檢與更新
年檢：獲得EDI許可證后，企業需每年進行年檢，提交年檢報告和業務年檢報表。
更新：如企業信息發生變更，需及時更新相關信息，并按要求重新提交材料。
6. 特別提示
實體店轉線上銷售：原在實體店銷售的商品轉為線上銷售，不屬于EDI許可證的業務范疇，無需申請EDI許可證。
互聯網金融業務：網絡借貸、股權眾籌融資等互聯網金融業務需申請在線數據處理與交易處理業務許可，而其他如互聯網支付、基金銷售、保險等業務僅需進行網站備案。
總結
深圳EDI許可證的辦理流程涉及系統評測、材料準備、網上審核、制證和領取證書、年檢與更新等多個環節。企業需確保滿足所有條件，準備齊全的申請材料，并按照流程完成申請。此外，對于特定業務類型，企業還需注意是否需要額外的行業預批準。